Je to jednoduché stačí spusťiť tento príkaz:

gsettings set org.gnome.desktop.default-applications.terminal exec $(which hyper)

Vysvetlenie: Tento príkaz sa skladá z dvoch častí, prvá nastaví defaultny terminál pre gnome gsettings set org.gnome.desktop.default-applications.terminal exec, $(which hyper) a druhá nájde odkaz na executable hyper terminálu.

Zdroj